از مشکلات و معضلاتی استفاده از پنلهای خورشیدی کثیف شدن سطح پنل خورشیدی است به ویژه در نقاط با آلایندگی و رطوبت بالا میباشد که عملکرد پنلها را با محدودیت مواجه میکند. برای شستشوی پنلها روشهای متعدد دستی، مکانیزه و رباتیک وجود دارد.
در صورت بزرگ بودن نیروگاه ، شما باید به این عمل به عنوان یک هزینه نگهداری دائم نگاه کرده و برای آن حتما برنامه و پلن مشخصی داشته باشید. البته سیستم شما باید به گونهای طراحی و اجرا شود که امکان راه رفتن در بین آرایهها و شستشوی راحت آنها وجود داشته باشد، وگرنه بعدها با مشکل روبرو خواهید شد.